據(jù)臺灣媒體報道，“行政院”組織改造，從國民黨執(zhí)政，換到民進黨執(zhí)政，再到國民黨重新執(zhí)政，前后拖延數(shù)十年，總算邁開腳步，但是組織改造過程，卻暴露出機關(guān)本位主義，缺乏通盤檢討的問題。勞委會、“衛(wèi)生署”都因為業(yè)務(wù)的專業(yè)考量，主張將原先的聘雇人員，在改制過程中轉(zhuǎn)為編制內(nèi)公務(wù)員，因為人事員額暴增，增加財政支出總計超過百億元（新臺幣，下同），這與組織整并的政策目標(biāo)剛好是背道而馳。

　　組織改造推動困難，多半因為部會的本位考量各行其是，私下運作各方，通過“立委”牽制“行政院”方面的決策，扭曲組織改造的政策目標(biāo)。當(dāng)局推動組織改造，是要精簡人力，降低非必要的人事支出，曾經(jīng)是百萬大軍的臺防務(wù)部門，都砍到剩下20多萬人，但部分機關(guān)在裁并過程中，不能思考改造的政策目標(biāo)，只想保有現(xiàn)有的資源，就會出現(xiàn)越改造人越多，人事負(fù)擔(dān)越沉重。

　　“行政院”主其事者沒有能夠拿起政治責(zé)任，遏止機關(guān)本位主義，才會造成這種機關(guān)精簡整并后，編制人員卻更多的怪現(xiàn)象�！靶姓�院”根本就不該對“勞委會”、“衛(wèi)生署”大開方便之門，破壞的官制官規(guī)，不僅違反組織精簡的目標(biāo)，更是破壞人事政策與法規(guī)。

　　當(dāng)局有許多業(yè)務(wù)需要專業(yè)人士，無可厚非，但現(xiàn)況許多專業(yè)人士無法滿足公務(wù)人員的任用資格，也是事實，要解決這個問題，并不是簡單的把編制外人員納編，破壞文官體制的穩(wěn)定。政府應(yīng)該思考的是如何改變?nèi)耸轮贫�，�?chuàng)造一個管道，讓專業(yè)人士可以成為公務(wù)員，而不是用艱澀的考試，嚇跑專業(yè)人才，影響取才。

　　“銓敘部次長”吳聰成：為了公平正義 非擋不可

　　組織改造，“銓敘部”統(tǒng)計，光是“勞保局”、“健保局”兩個單位，就各有488人、469人有機會轉(zhuǎn)任公務(wù)人員，一旦順利轉(zhuǎn)任，近千人未來的月退俸就將讓公庫增加104億元（新臺幣，下同）。“銓敘部次長”吳聰成態(tài)度堅決地說“為了公平正義，非擋不可！”